У стен Спасской церкви были совершены самые первые захоронения в Иркутске, но они не сохранились. К началу XX века сохранились всего девять погребений, сделанных во второй половине XIX и начале XX века. Это могилы:

• протоиерея Иннокентия Александровича Виноградова (умер 21.4.1904)
• священника Иакова Николаевича Черных (умер 29.12.1897) - инициатора создания иркутской городской церковно-приходской школы
• священника Василия Багрянцева
• Петра Затопляева - псаломщика, прослужившего при церкви 50 лет
• иркутского купца Ивана Александровича Федченко (умер в 1874 году)
• мещанина Бориа Ивановича Стрекаловского (умер 6.7.1905)
• действительного статского советника Ивана Григорьевича Яковенко (умер 14.9.1883)
• его жены Людмилы Ивановны Яковенко (умерла 4.3.1908)
• двенадцатилетней девочки, дочери чиновника, зоолога, члена ВСОРГО, сотрудничевшего в "Восточном обозрении" Дмитрия Петровича Першина